Couleurs par défaut

Le code R suivant modifie la couleur du graphique en fonction des niveaux de dose:

# Box plot
bp<-ggplot(ToothGrowth, aes(x=dose, y=len, fill=dose)) +
  geom_boxplot()
bp
# Nuage de points
sp<-ggplot(mtcars, aes(x=wt, y=mpg, color=cyl)) + geom_point()
sp

La luminosité (l) et la chrominance (c, intensité de la couleur) de la couleur par défaut (hue) peuvent être modifiées en utilisant les fonctions scale_hue comme suit:

# Box plot
bp + scale_fill_hue(l=40, c=35)
# Nuage de points
sp + scale_color_hue(l=40, c=35)

Notez que les valeurs par défaut pour l et c sont les suivantes: l = 65, c = 100.

Changer les couleurs manuellement

Des palettes de couleurs personnalisées peuvent être spécifiées en utilisant les fonctions :

• scale_fill_manual() pour un box plot, bar plot, violin plot, etc
• scale_color_manual() pour des graphiques linéaires, ou des nuages de points

# Box plot
bp + scale_fill_manual(values=c("#999999", "#E69F00", "#56B4E9"))
# Nuage de points
sp + scale_color_manual(values=c("#999999", "#E69F00", "#56B4E9"))

Notez que, l’argument breaks peut être utilisé pour contrôler l’apparence de la légende. Ceci est aussi vrai pour les autres fonctions scale_xx().

# Box plot
bp + scale_fill_manual(breaks = c("2", "1", "0.5"), 
                       values=c("red", "blue", "green"))
# Nuage de points
sp + scale_color_manual(breaks = c("8", "6", "4"),
                        values=c("red", "blue", "green"))

Lire plus sur les couleurs ici : Couleurs dans R.

Utiliser les palettes de couleurs RColorBrewer

Les palettes de couleurs disponibles dans le package RColorBrewer sont décrites ici: Couleurs dans R.

# Box plot
bp + scale_fill_brewer(palette="Dark2")
# Nuage de points
sp + scale_color_brewer(palette="Dark2")

Les palettes de couleurs disponibles dans le package RColorBrewer sont:

Utiliser les palettes de couleurs Wes Anderson

Installer et charger les palettes de couleurs comme suit:

# Installer
install.packages("wesanderson")
# Charger
library(wesanderson)

Les palettes de couleurs disponibles sont:

library(wesanderson)
# Box plot
bp+scale_fill_manual(values=wes_palette(n=3, name="GrandBudapest"))
# Nuage de points
sp+scale_color_manual(values=wes_palette(n=3, name="GrandBudapest"))

Gradients de couleurs pour un graphique en nuage de points

Les graphiques sont colorés en utilisant la variable continue qsec:

# Colorer en fonction de la valeur de qsec
sp2<-ggplot(mtcars, aes(x=wt, y=mpg, color=qsec)) + geom_point()
sp2
# Changer les couleurs basse et haute
# Gradient sequentiel
sp2+scale_color_gradient(low="blue", high="red")
# Gradients divergents
mid<-mean(mtcars$qsec)
sp2+scale_color_gradient2(midpoint=mid,  low="blue", mid="white",
                  high="red"  space = "Lab")

Gradients de couleurs pour histogrammes

set.seed(1234)
x <- rnorm(200)
# Histogramme
hp<-qplot(x =x, fill=..count.., geom="histogram") 
hp
# Gradient séquentiel
hp+scale_fill_gradient(low="blue", high="red")

Notez que, les fonctions scale_color_continuous() et scale_fill_continuous() peuvent être utilisées aussi pour les gradients de couleurs.

Gradients entre n couleurs

# Nuage de points
# Colorer les points en fonction de la variable mpg
sp3<-ggplot(mtcars, aes(x=wt, y=mpg, color=mpg)) + geom_point()
sp3
# Gradient entre n couleurs
sp3+scale_color_gradientn(colours = rainbow(5))