Visualiser une matrice de corr?lation en utilisant la fonction symnum
Cet article d?crit comment faire un graphique de la matice de corr?lation dans R. La fonction symnum() de R est utilis?e. Elle prend comme argument la table de corr?lation. Le r?sultat est une table dans laquelle les coefficients de corr?lation sont remplac?s par des symboles en fonction du d?gr? de corr?lation.
Graphique de la matrice de corr?lation en utilisant la fonction symnum
La fonction symnum de R peut ?tre utilis?e pour mettre en ?vidence, tr?s facilement, les variables les plus corr?l?es. Elle remplace les coefficients de corr?lation par des symboles en fonction de la valeur.
Le format simplifi? de la fonction est :
symnum(x, cutpoints = c(0.3, 0.6, 0.8, 0.9, 0.95),
symbols = c(" ", ".", ",", "+", "*", "B"))- x est la matrice de corr?lation ? visualiser - cutpoints : Les cutpoints des coefficients de corr?lation. Les coefficients de corr?lation entre 0 et 0.3 sont remplac?s par un espace (" ?); les coefficients de corr?lation entre 0.3 et 0.6 sont remplac?s par?.?; etc ? - symbols : Les symboles ? utiliser.
Le code R suivant calcule la table de corr?lation et affiche un graphique de la matrice de corr?lation:
## Matrice de corr?lation
corMat<-cor(mtcars)
head(round(corMat,2)) mpg cyl disp hp drat wt qsec vs am gear carb
mpg 1.00 -0.85 -0.85 -0.78 0.68 -0.87 0.42 0.66 0.60 0.48 -0.55
cyl -0.85 1.00 0.90 0.83 -0.70 0.78 -0.59 -0.81 -0.52 -0.49 0.53
disp -0.85 0.90 1.00 0.79 -0.71 0.89 -0.43 -0.71 -0.59 -0.56 0.39
hp -0.78 0.83 0.79 1.00 -0.45 0.66 -0.71 -0.72 -0.24 -0.13 0.75
drat 0.68 -0.70 -0.71 -0.45 1.00 -0.71 0.09 0.44 0.71 0.70 -0.09
wt -0.87 0.78 0.89 0.66 -0.71 1.00 -0.17 -0.55 -0.69 -0.58 0.43## Graphique de la corr?lation
## abbr.colnames=FALSE pour ?viter que
#le nom des colonnnes soit abbr?g?s
symnum(corMat, abbr.colnames=FALSE) mpg cyl disp hp drat wt qsec vs am gear carb
mpg 1
cyl + 1
disp + * 1
hp , + , 1
drat , , , . 1
wt + , + , , 1
qsec . . . , 1
vs , + , , . . , 1
am . . . , , 1
gear . . . , . , 1
carb . . . , . , . 1
attr(,"legend")
[1] 0 ' ' 0.3 '.' 0.6 ',' 0.8 '+' 0.9 '*' 0.95 'B' 1Conclusions
Une des m?thodes faciles pour visualiser une matrice de corr?lation dans R est d?utiliser la fonction symnum.
Infos
Cette analyse a ?t? faite avec R (ver. 3.1.0).
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