ANOVA : Analyse de variance avec R

L'ANOVA permet de voir si une variable numérique a des valeurs différentes en fonction de plusieurs groupes. C'est une généralisation du test de Student permettant de comparer plus de deux groupes.


La commande à utiliser est :

Code R :
 
fit <- aov(y ~ A, data=mydataframe) # y est la variable numérique et A indique les groupes
summary(fit)
 


Exemple :

Code R :
 
fr <- data.frame(var = c(10, 4, 5, 3, 3, 7, 2, 6, 2, 8, 5),
                 group = factor(c("c", "a", "b", "a", "b", "b", "a", "b", "a", "c", "c")))#table de données
fit <- aov(var ~ group, fr)# analyse de variance
summary(fit)
 



Résultat de la commande:

            Df Sum Sq Mean Sq F value  Pr(>F)  
group        2 41.833 20.9167  6.9241 0.01798 *
Residuals    8 24.167  3.0208                  
---
Signif. codes:  0 ‘***’ 0.001 ‘**’ 0.01 ‘*’ 0.05 ‘.’ 0.1 ‘ ’ 1


Le test renvoie une p-value significative; p = 0.018.

Dans le cas d'un test d' ANOVA, même si le test est significatif, on ne sait par contre pas quelles catégories sont concernées. Il faudra donc faire un test de Student pour comparer les groupes 2 par 2.



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