Corr?lation simple et matrice de corr?lation-Logiciel
Corr?lation et matrice de corr?lation - Logiciel
Ce logiciel permet de faire des corr?lations entre 2 variables (Var 1 et var 2) ou une matrice de corr?lation entre les variables.
Il calcule ?galement la corr?lation entre une variable et l'ensemble des variables contenues dans un fichier ? la demande de l'utilisateur en un seul clic.
Il permet ?galement une visualisation graphique de la matrice de corr?lation en remplacent les coefficients de corr?lation par un code symboles ou code couleurs(heatmap).
Tuto corr?lation...
Compatibilit? : Windows/Vista
Interface graphique
Clicquer pour voir
Format de fichier
Fichier .txt tabulation.
| Sample | IND1 | IND2 | IND3 | IND4 | IND5 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1558438_a_at | 9 | 67 | 137 | 156 | 14 |
| 205363_at | 3 | 5 | 296 | 35 | 78 |
| 212328_at | 30 | 18 | 3 | 4 | 11 |
| 216984_x_at | 789 | 126 | 343 | 239 | 48 |
| 244002_at | 5 | 6 | 3 | 4 | 1 |
| 243621_at | 10 | 5 | 16 | 19 | 5 |
| 209013_x_at | 20 | 9 | 7 | 5 | 1 |
| 210130_s_at | 13 | 145 | 266 | 92 | 566 |
| 234419_x_at | 30 | 29 | 9 | 10 | 428 |
| 201042_at | 36 | 9 | 2 | 3 | 19 |
Les variables sont en ligne et les individus (ou les cas) sont en colonne. Lorsque le fichier est import? la liste des variables est affich?e. Si le fichier contient un grand nombre de variables, seule une partie est affich?e.
M?thode de calcul du coefficient de corr?lation
Pearson, Spearman, Kendall (voir Cours).
Corr?lation simple
La corr?lation est faite soit entre 2 variables (dans ce cas renseigner les champs var 1 et var 2) soit entre une variable et la liste des variables pr?sentes dans le fichier.
R?sultats
| Variables | Correlation coefficient with 1558438_a_at | Pvalue |
|---|---|---|
| 1558438_a_at | 1 | 0 |
| 205363_at | -0.0564152966187128 | 0.697174934704701 |
| 212328_at | -0.0541207204249129 | 0.708935809991179 |
| 216984_x_at | 0.380015134661465 | 0.00648696707993257 |
| 244002_at | 0.0167155685742629 | 0.908274424753708 |
| 243621_at | -0.00907290171655688 | 0.950137841110302 |
| 209013_x_at | 0.122434069288554 | 0.396975152897195 |
| 210130_s_at | -0.186874574744441 | 0.193785210968740 |
| 234419_x_at | -0.0378103543501896 | 0.794331211893068 |
| 201042_at | 0.0256599360104259 | 0.85960031166943 |
Matrice de corr?lation
Calcule le coefficient de corr?lation entre chaque variable et l'ensemble des variables dans le fichier
R?sultats
Matrice montrant les co?fficient de corr?lation
| Variables | 1558438_a_at | 205363_at | 212328_at | 216984_x_at | 244002_at | 243621_at | 209013_x_at | 210130_s_at |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1558438_a_at | 1 | -0.0564 | -0.0541 | 0.38 | 0.0167 | -0.00907 | 0.122 | -0.187 |
| 205363_at | -0.0564 | 1 | -0.0656 | -0.0414 | -0.056 | 0.252 | -0.0352 | 0.223 |
| 212328_at | -0.0541 | -0.0656 | 1 | -0.0481 | 0.0306 | -0.0286 | -0.105 | -0.0162 |
| 216984_x_at | 0.38 | -0.0414 | -0.0481 | 1 | 0.0428 | -0.0379 | 0.179 | -0.123 |
| 244002_at | 0.0167 | -0.056 | 0.0306 | 0.0428 | 1 | -0.00256 | 0.00255 | 0.0258 |
| 243621_at | -0.00907 | 0.252 | -0.0286 | -0.0379 | -0.00256 | 1 | -0.0211 | 0.312 |
| 209013_x_at | 0.122 | -0.0352 | -0.105 | 0.179 | 0.00255 | -0.0211 | 1 | -0.184 |
| 210130_s_at | -0.187 | 0.223 | -0.0162 | -0.123 | 0.0258 | 0.312 | -0.184 | 1 |
R?pr?sentation graphique de la matrice de corr?lation
Les co?fficents de corr?lation sont remplac?s par des symboles en fonction de leurs valeurs 0 ' ' 0.25 '?' 0.5 '#' 0.75 '??' 0.9 '++' 0.95 '**' 1
| Variables | 1558438_a_at | 205363_at | 212328_at | 216984_x_at | 244002_at | 243621_at | 209013_x_at | 210130_s_at |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1558438_a_at | 1 | |||||||
| 205363_at | 1 | |||||||
| 212328_at | 1 | |||||||
| 216984_x_at | ? | 1 | ||||||
| 244002_at | 1 | |||||||
| 243621_at | ? | 1 | ||||||
| 209013_x_at | 1 | |||||||
| 210130_s_at | ? | 1 |
Les co?fficents de corr?lation sont remplac?s par des symboles en fonction de la significativit? statistique 1 '' 0.05 '?' 0.025 '#' 0.01 '??' 0.001 '++' 0.0001 '** '1
| Variables | 1558438_a_at | 205363_at | 212328_at | 216984_x_at | 244002_at | 243621_at | 209013_x_at | 210130_s_at | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1558438_a_at | 1 | ||||||||
| 205363_at | 1 | ||||||||
| 212328_at | 1 | ||||||||
| 216984_x_at | ?? | 1 | |||||||
| 244002_at | 1 | ||||||||
| 243621_at | 1 | ||||||||
| 209013_x_at | 1 | ||||||||
| 210130_s_at | ? | 1 |
heatmap de la matrice de corr?lation
Matrice de couleur en fonction de la force de la corr?lation entre les variables
