Documentation

Boxplot avec RQuery

Sun, 26 Oct 2014 19:06:48 +0100

Le but de ce tuto est de vous montrer comment faire un boxplot avec RQuery.
La fonction ? utiliser s'appelle rquery.boxplot

Format du fichier

Le fichier accept? est au format .txt tabulation. Les variables sont en colonnes.

T?l?charger un exemple de fichier en cliquant ici

Enregistrer le fichier au format .txt tabulation.
Le fichier contient une colonne appel?e variable et une autre appel?e Group

Pour en savoir plus sur le format de fichier accept? suivre le lien suivant : Importation et exportation des donn?es avec RQuery-1.0

Utilisation de la fonction rquery.boxplot

Un boxplot simple

Code R :

rquery.boxplot(yName="variable", grpName="Group")

La fonction prend comme param?tre le nom de la variable d'int?r?t dans le fichier (ici 'variable') et le nom de l'ent?te de la colonne indiquant le groupe (ici 'Group').

R vous demandera d'indiquer le fichier contenant les donn?es. Indiquer le chemin du fichier que vous venez de t?l?charger.

Ci-dessous le graphique g?n?r?:

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Les 2 petits ronds au niveau des groupes C et D correspondent ? des valeurs atypiques.

Cacher les valeurs atypiques (ou extr?mes)

Pour cacher les valeurs atypiques on fournit ? la fonction le param?tre outline en lui attribuant la valeur FALSE

Code R :

rquery.boxplot(yName="variable", grpName="Group", outline =FALSE)

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Afficher chaque point (chaque valeur) sur le boxplot

Utilisation de l'option marqueur=TRUE

Code R :

rquery.boxplot(yName="variable", grpName="Group", marqueur=TRUE)

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Coloration du boxplot en fonction du groupe

Utilisation de l'option colorieParGrpe=TRUE

Code R :

rquery.boxplot(yName="variable", grpName="Group", marqueur=TRUE, colorieParGrpe=TRUE)

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Utilisateur avanc?

rquery.boxplot

Q-Q plot avec RQuery

Thu, 18 Aug 2011 11:12:50 +0200

La fonction ? utiliser s'appelle rquery.qqplot

Q-Q plot : quantile-quantile plot (tra?age des quantiles d'une distribution versus les quantiles d'une autre distribution).

qqplot : permet de comparer graphiquement les distributions de 2 ?chantillons pour savoir si elles sont identiques. Si les points sont align?s, les 2 ?chantillons ont des distributions similaires, sinon elles ne le sont pas .

Format du fichier

Le fichier accept? est au format .txt tabulation. Les variables sont en colonnes.

T?l?charger un exemple de fichier en cliquant ici

Enregistrer le fichier au format .txt tabulation.
Le fichier contient une colonne nom et 3 colonnes de variables (var1, var2, var3)

Pour en savoir plus sur le format de fichier accept? suivre le lien suivant : Importation et exportation des donn?es avec RQuery-1.0

Utilisation de la fonction rquery.qqplot

Comparaison d'une distribution ? une distribution th?orique

Code R :

rquery.qqplot(xName="var1")

La fonction prend comme param?tre le nom de la variable d'int?r?t dans le fichier (ici 'var1')

R vous demandera d'indiquer le fichier contenant les donn?es. Indiquer le chemin du fichier que vous venez de t?l?charger.

Ci-dessous le graphique g?n?r?:

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Comparaison de 2 distributions

Code R :

rquery.qqplot(xName="var1", yName="var2")

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Utilisateur avanc?

rquery.qqplot

Nuage de points avec RQuery

Thu, 18 Aug 2011 11:11:58 +0200

La fonction ? utiliser s'appelle rquery.scatterplot

Format du fichier

Le fichier accept? est au format .txt tabulation. Les variables sont en colonnes.

T?l?charger un exemple de fichier en cliquant ici

Enregistrer le fichier au format .txt tabulation.
Le fichier contient une colonne appel?e nom et 4 autres colonnes Long.jump, 1500m , Javeline, competition. La colonne competition correspond aux groupes

Pour en savoir plus sur le format de fichier accept? suivre le lien suivant : Importation et exportation des donn?es avec RQuery-1.0

Utilisation de la fonction rquery.scatterplot

Nuage de point simple

Code R :

 
 
rquery.scatterplot(xName="Long.jump",  yName="Javeline")

La fonction prend comme param?tre le nom des variables x et y.
R vous demandera d'indiquer le fichier contenant les donn?es. Indiquer le chemin du fichier que vous venez de t?l?charger.

Ci-dessous le graphique g?n?r?:

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Le graphique contient :

Le nuage de point
La droite de r?gression lin?aire en vert
L'?tendue en pointill? (tiret rouge)
La courbe de lissage des donn?es (trait plein, rouge)

Affichage du nom des points

Utilisation de l'option identify=TRUE et identifyName="nom"; "nom" est le nom de la colonne correspondant aux ?tiquettes des points.

Code R :

 
 
rquery.scatterplot(xName="Long.jump", yName="Javeline",  identifyPlot=TRUE, identifyName="nom")

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Ellipse de concentration

Utilisation de l'option ellipse=TRUE

Code R :

 
 
rquery.scatterplot(xName="Long.jump", yName="Javeline",  identifyPlot=TRUE, identifyName="nom", ellipse=TRUE)

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Cacher l'?tendue et la courbe de lissage

pour cacher l'?tendue, utiliser l'option spread=FALSE
pour cacher la courbe de lissage, utiliser l'option smooth=FALSE

Code R :

 
 
rquery.scatterplot(xName="Long.jump", yName="Javeline",  smooth=FALSE, spread=FALSE)

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pour cacher la droite de r?gression lin?aire, utilisez l'option reg.line=""

Utilisateur avanc?

rquery.scatterplot

Histogramme avec RQuery

Thu, 18 Aug 2011 10:45:12 +0200

La fonction ? utiliser s'appelle rquery.hist

Format du fichier

Le fichier accept? est au format .txt tabulation. Les variables sont en colonnes.

T?l?charger un exemple de fichier en cliquant ici

Enregistrer le fichier au format .txt tabulation.
Le fichier contient une colonne appel?e variable et une autre appel?e Nom

Pour en savoir plus sur le format de fichier accept? suivre le lien suivant : Importation et exportation des donn?es avec RQuery-1.0

Utilisation de la fonction rquery.hist

Histogramme de distribution

Code R :

rquery.hist(yName="variable")

La fonction prend comme param?tre le nom de la variable d'int?r?t dans le fichier (ici 'variable')

R vous demandera d'indiquer le fichier contenant les donn?es. Indiquer le chemin du fichier que vous venez de t?l?charger.

Ci-dessous le graphique g?n?r?:

Affichage de la courbe normale

Code R :

rquery.hist(yName="variable", normal_curve=TRUE)

Utilisateur avanc?

rquery.hist

Graphique 3D avec RQuery

Thu, 18 Aug 2011 10:44:49 +0200

La fonction ? utiliser s'appelle rquery.scatter3d

Format du fichier

Le fichier accept? est au format .txt tabulation. Les variables sont en colonnes.

T?l?charger un exemple de fichier en cliquant ici

Enregistrer le fichier au format .txt tabulation.
Le fichier contient une colonne appel?e nom et 4 autres colonnes Long.jump, 1500m , Javeline, competition. La colonne competition correspond aux groupes

Pour en savoir plus sur le format de fichier accept? suivre le lien suivant : Importation et exportation des donn?es avec RQuery-1.0

Utilisation de la fonction rquery.scatter3d

Un graphique 3D simple

Code R :

 
 
rquery.scatter3d(xName="Long.jump", yName="1500m", zName="Javeline")

La fonction prend comme param?tre le nom des variables x, y et z.
R vous demandera d'indiquer le fichier contenant les donn?es. Indiquer le chemin du fichier que vous venez de t?l?charger.

Ci-dessous le graphique g?n?r?:

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Affichage de la surface des moindres carr?s lin?aires

On fournit ? la fonction le param?tre surface en lui attribuant la valeur TRUE

Code R :

 
 
rquery.scatter3d(xName="Long.jump", yName="1500m", zName="Javeline", surface=TRUE)

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Affichage de l'ellipse de concentration des donn?es

Utilisation de l'option ellipsoid=TRUE

Code R :

 
 
rquery.scatter3d(xName="Long.jump", yName="1500m", zName="Javeline", surface=TRUE, ellipsoid=TRUE)

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Graphique 3D en fonction du groupe

Si le fichier contient une colonne correspondant aux groupes (ce qui est le cas ici), utilisation de l'option grpName. Dans l'exemple du fichier t?l?charg? grpName="competition".

Code R :

 
 
rquery.scatter3d(xName="Long.jump", yName="1500m", zName="Javeline",  ellipsoid=TRUE, grpName="competition")

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Dans le code ci-dessous, j'ai enlev? l'option surface=TRUE

Affichage du nom des points

Utilisation de l'option identify=TRUE et identifyName="nom"; "nom" est le nom de la colonne correspondant aux ?tiquettes des points.

Code R :

 
 
rquery.scatter3d(xName="Long.jump", yName="1500m", zName="Javeline",  ellipsoid=TRUE, grpName="competition", identifyPlot=TRUE, identifyName="nom")

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--- Affichage d'un cadre autour du graphique---

Utilisation du param?tre bbox=TRUE .

Code R :

 
 
rquery.scatter3d(xName="Long.jump", yName="1500m", zName="Javeline",  ellipsoid=TRUE, grpName="competition", identifyPlot=TRUE, identifyName="nom", bbox=TRUE)

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Utilisateur avanc?

rquery.scatter3d

Graphe en camembert avec RQuery

Thu, 18 Aug 2011 10:44:10 +0200

La fonction ? utiliser s'appelle rquery.piechart

Format du fichier

Le fichier accept? est au format .txt tabulation. Les variables sont en colonnes.

T?l?charger un exemple de fichier en cliquant ici

Enregistrer le fichier au format .txt tabulation.
Le fichier contient une colonne appel?e variable et une autre appel?e Nom

Pour en savoir plus sur le format de fichier accept? suivre le lien suivant : Importation et exportation des donn?es avec RQuery-1.0

Utilisation de la fonction rquery.piechart

Graphique simple

Code R :

rquery.piechart(yName="variable")

Affichage des ?tiquettes

utilisation du param?tre labels. Dans l'exemple du fichier que vous avez t?l?charg? labels="Nom" c'est ? dire la colonne 'nom' du fichier.

Code R :

rquery.piechart(yName="variable", labels="Nom")

Graphique 3D

Code R :

rquery.barplot(yName="variable", pie3d=TRUE

Utilisateur avanc?

rquery.piechart

Graphe en barre avec RQuery

Thu, 18 Aug 2011 10:43:24 +0200

La fonction ? utiliser s'appelle rquery.barplot

Format du fichier

Utilisation de la fonction rquery.barplot

Graphique simple

Code R :

rquery.barplot(yName="variable")

Trie des donn?es

On peut trier les donn?es avec le param?tre y.sort=TRUE. Pour colorer chaque barre en fonction de l'intensit? de la valeur, il faut utiliser le param?tre colEachBar=TRUE.

Code R :

rquery.barplot(yName="variable", y.sort=TRUE, colEachBar=TRUE)

ci-dessous le r?sultat:

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Barplot en fonction du group

Comme notre fichier contient une colonne 'Group', nous allons faire le barplot en fonction du groupe.

Code R :

rquery.barplot(yName="variable", grpName="Group")

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Affichage des ?tiquettes

utilisation des param?tres etiquette=TRUE et etiquetteName. etiquetteName correspond au nom de la colonne contenant l’?tiquette des barres. Dans l'exemple du fichier que vous avez t?l?charg? etiquetteName="Nom" c'est ? dire la colonne 'nom' du fichier.

Code R :

rquery.barplot(yName="variable", grpName="Group", etiquette=TRUE, etiquetteName="Nom")

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Affichage de la l?gende

Code R :

rquery.barplot(yName="variable", grpName="Group", legend=TRUE)

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Utilisateur avanc?

rquery.barplot

Graphe en bande avec RQuery

Thu, 18 Aug 2011 10:42:54 +0200

La fonction ? utiliser s'appelle rquery.stripchart

Format du fichier

Utilisation de la fonction rquery.stripchart

Code R :

rquery.stripchart(yName="variable", grpName="Group")

La fonction prend comme param?tre le nom de la variable d'int?r?t dans le fichier (ici 'variable') et le nom de l'ent?te de la colonne indiquant le groupe (ici 'Group').

R vous demandera d'indiquer le fichier contenant les donn?es. Indiquer le chemin du fichier que vous venez de t?l?charger.

Ci-dessous le graphique g?n?r?:

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Pour d?caler les points correspondant aux valeurs dupliqu?es, on utilise le param?tre method=jitter

Code R :

rquery.stripchart(yName="variable", grpName="Group", method="jitter")

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Repr?senter les marqueurs par des points ? la place des carr?s :
param?tre pch=19

Code R :

rquery.stripchart(yName="variable", grpName="Group", method="jitter", pch=19)

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Utilisateur avanc?

rquery.stripchart

Graphe des moyennes avec RQuery

Thu, 18 Aug 2011 10:39:11 +0200

Le but de ce tuto est de vous montrer comment faire un graphique des moyennes avec RQuery.
La fonction ? utiliser s'appelle rquery.plotMeans

Format du fichier

Utilisation de la fonction rquery.plotMeans

Code R :

rquery.plotMeans(yName="variable", grpName="Group")

La fonction prend comme param?tre le nom de la variable d'int?r?t dans le fichier (ici 'variable') et le nom de l'ent?te de la colonne indiquant le groupe (ici 'Group').

R vous demandera d'indiquer le fichier contenant les donn?es. Indiquer le chemin du fichier que vous venez de t?l?charger.

La moyenne de chaque groupe est repr?sent?e par un gros point et les barres d'erreur sont montr?es.

Ci-dessous le graphique g?n?r?:

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Utilisateur avanc?

rquery.plotMeans

Courbe de densité avec RQuery

Thu, 18 Aug 2011 10:38:39 +0200

La fonction ? utiliser s'appelle rquery.density

Format du fichier

Le fichier accept? est au format .txt tabulation. Les variables sont en colonnes.

T?l?charger un exemple de fichier en cliquant ici

Enregistrer le fichier au format .txt tabulation.
Le fichier contient une colonne appel?e variable et une autre appel?e Nom

Pour en savoir plus sur le format de fichier accept? suivre le lien suivant : Importation et exportation des donn?es avec RQuery-1.0

Utilisation de la fonction rquery.density

Courbe de densit? simple

Code R :

rquery.density(yName="variable")

Remplissage de la courbe

Code R :

rquery.density(yName="variable", fill=TRUE)

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Comparaison de groupes avec la courbe de densit?

Il faut indiquer le param?tre grpName ? la fonction. Ici, grpName est ?gal au nom de la colonne contenant les groupes

Code R :

rquery.density(yName="variable", grpName="Group")

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Utilisateur avanc?

rquery.density